Produk

Kajian kromatin immunoprecipitation (ChIP) seluruh genom telah membawa pandangan yang ketara ke dalam penyetempatan genom protein berkaitan kromatin dan pengubahsuaian histon.Jumlah besar data yang dijana oleh analisis ini, bagaimanapun, memerlukan pendekatan yang membolehkan pengesahan pantas dan analisis perkaitan biologi.Tambahan pula, masih terdapat sasaran protein dan pengubahsuaian yang sukar dikesan menggunakan kaedah ChIP standard.Untuk menangani isu ini, kami membangunkan prosedur imunopresipitasi kromatin segera yang kami panggil ZipChip.ZipChip mengurangkan masa dengan ketara dan meningkatkan sensitiviti yang membolehkan penyaringan pantas beberapa lokus.Di sini kami menerangkan bagaimana ZipChIP membolehkan pengesanan pengubahsuaian histon (H3K4 mono- dan trimethylation) dan dua demetilase histon yis, Jhd2 dan Rph1, yang sebelum ini sukar untuk dikesan menggunakan kaedah standard.Tambahan pula, kami menunjukkan fleksibiliti ZipChIP dengan menganalisis pengayaan histone deacet ylase Sir2 pada heterochromatin dalam yis dan pengayaan pengubah semula kromatin, PICKLE, pada euchromatin dalam Arabidopsis thaliana.