Produk

Laluan molekul patogen dalam penyakit hati sirosis seperti virus hepatitis C (HCV), hepatitis autoimun (AIH) dan sirosis hempedu primer (PBC) kurang dicirikan.Gen yang dinyatakan secara berbeza selalunya penting dalam patogenesis penyakit.Hibridisasi subtraktif penindasan (SSH) ialah pendekatan luas genom yang memperkayakan transkrip mRNA yang dinyatakan secara berbeza.Kami berhasrat untuk membuat pemerhatian baru terhadap ekspresi gen pembezaan dalam sirosis menggunakan SSH digabungkan dengan tindak balas rantai polimerase transkripase terbalik masa nyata kuantitatif (RT-PCR).Transkriptom hati dalam sirosis HCV, sirosis AIH, PBC, dan tisu hati yang tidak sakit telah diperiksa oleh SSH.Klon DNA pelengkap (cDNA) yang terhasil telah disaring semula untuk ekspresi pembezaan oleh hibridisasi dot-blot dan kemudian dijujukan.Ekspresi gen terpilih dikira oleh RT-PCR masa nyata.Berikutan SSH, 694 klon telah disaring semula untuk ekspresi gen berbeza, di mana 145 telah disusun dan didapati berasal daripada 89 gen berbeza.Tujuh klon adalah homolog hanya dengan gen pengekodan jujukan tag jujukan (EST) yang tidak mempunyai fungsi yang diketahui.Ekspresi terkawal empat gen telah disahkan oleh RT-PCR masa nyata: transmembrane 4 ahli superfamili 3 (tetraspanin CO-029) dalam semua bentuk sirosis, protein berinteraksi landak (HIP) dalam sirosis AIH dan chitinase 3-like-1 (HC gp-39 atau ykl-40) dan ulangan asid arginin-glutamat (RERE) dalam sirosis HCV.Polimorfisme gen RERE dan varian sambatan diperhatikan dalam semua tisu yang diperiksa.Regulasi naik Tetraspanin CO-029 terutamanya disetempatkan kepada sel duktus hempedu.Kesimpulannya, pemerhatian baru terhadap ekspresi gen pembezaan dalam sirosis manusia telah dibuat menggunakan SSH sebagai alat penemuan utama.Khususnya, kajian lanjut tentang gen RERE dan produknya dalam penyakit hati berkaitan HCV adalah wajar.